Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAM2Q15035 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAM2Q15035 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAM2Q15035 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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