Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIN2CQ14957 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN2CQ14957 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2CQ14957 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
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