Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BECN1Q14457 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BECN1Q14457 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BECN1Q14457 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
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