Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM25Q14258 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM25Q14258 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM25Q14258 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM25Q14258 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM25Q14258 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM25Q14258 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM25Q14258 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM25Q14258 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM25Q14258 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM25Q14258 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM25Q14258 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM25Q14258 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM25Q14258 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM25Q14258 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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