Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOFQ13790 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOFQ13790 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOFQ13790 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOFQ13790 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOFQ13790 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOFQ13790 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOFQ13790 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOFQ13790 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOFQ13790 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOFQ13790 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOFQ13790 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOFQ13790 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APOFQ13790 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOFQ13790 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOFQ13790 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOFQ13790 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOFQ13790 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOFQ13790 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOFQ13790 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOFQ13790 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOFQ13790 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOFQ13790 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOFQ13790 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOFQ13790 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOFQ13790 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOFQ13790 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOFQ13790 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOFQ13790 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOFQ13790 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOFQ13790 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOFQ13790 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOFQ13790 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APOFQ13790 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOFQ13790 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOFQ13790 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOFQ13790 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOFQ13790 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOFQ13790 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOFQ13790 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOFQ13790 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOFQ13790 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOFQ13790 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOFQ13790 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOFQ13790 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOFQ13790 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOFQ13790 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOFQ13790 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOFQ13790 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOFQ13790 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOFQ13790 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOFQ13790 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOFQ13790 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOFQ13790 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOFQ13790 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOFQ13790 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOFQ13790 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOFQ13790 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOFQ13790 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOFQ13790 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOFQ13790 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOFQ13790 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOFQ13790 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOFQ13790 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOFQ13790 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOFQ13790 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOFQ13790 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOFQ13790 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOFQ13790 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOFQ13790 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOFQ13790 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOFQ13790 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOFQ13790 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOFQ13790 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOFQ13790 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOFQ13790 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOFQ13790 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOFQ13790 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOFQ13790 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOFQ13790 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOFQ13790 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOFQ13790 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOFQ13790 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOFQ13790 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOFQ13790 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOFQ13790 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOFQ13790 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOFQ13790 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOFQ13790 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOFQ13790 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOFQ13790 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOFQ13790 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOFQ13790 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOFQ13790 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOFQ13790 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOFQ13790 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOFQ13790 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOFQ13790 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOFQ13790 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOFQ13790 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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