Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALCAMQ13740 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALCAMQ13740 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALCAMQ13740 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
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