Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2DQ13557 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2DQ13557 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2DQ13557 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2DQ13557 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2DQ13557 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMK2DQ13557 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMK2DQ13557 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.1 ms