Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SQSTM1Q13501 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SQSTM1Q13501 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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