Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB3BPQ13352 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ITGB3BPQ13352 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms