Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLN3Q13286 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLN3Q13286 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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