Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3Q13114 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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TRAF3Q13114 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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TRAF3Q13114 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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TRAF3Q13114 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3Q13114 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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