Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT88Q13099 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT88Q13099 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
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