Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP1Q12981 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP1Q12981 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BNIP1Q12981 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP1Q12981 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP1Q12981 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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