Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPTFQ12830 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BPTFQ12830 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BPTFQ12830 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BPTFQ12830 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
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