Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
ARHGEF5Q12774 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARHGEF5Q12774 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARHGEF5Q12774 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARHGEF5Q12774 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARHGEF5Q12774 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARHGEF5Q12774 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARHGEF5Q12774 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ARHGEF5Q12774 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARHGEF5Q12774 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
ARHGEF5Q12774 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARHGEF5Q12774 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
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