Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIPPLY1Q0D2K3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms