Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFFO1Q0D2I5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFFO1Q0D2I5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms