Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
COL16A1Q07092 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
COL16A1Q07092 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
COL16A1Q07092 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 502.9 ms