Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCZQ05513 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKCZQ05513 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKCZQ05513 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKCZQ05513 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKCZQ05513 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKCZQ05513 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKCZQ05513 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKCZQ05513 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRKCZQ05513 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKCZQ05513 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCZQ05513 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCZQ05513 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCZQ05513 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCZQ05513 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKCZQ05513 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKCZQ05513 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKCZQ05513 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKCZQ05513 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCZQ05513 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCZQ05513 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCZQ05513 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRKCZQ05513 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCZQ05513 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKCZQ05513 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKCZQ05513 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKCZQ05513 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PRKCZQ05513 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRKCZQ05513 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms