Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFHR1Q03591 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFHR1Q03591 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFHR1Q03591 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms