Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROM1Q03395 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ROM1Q03395 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms