Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV1Q03135 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAV1Q03135 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms