Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NHLH2Q02577 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NHLH2Q02577 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NHLH2Q02577 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms