Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NHLH1Q02575 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NHLH1Q02575 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NHLH1Q02575 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHLH1Q02575 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms