Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MUC3AQ02505 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3AQ02505 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUC3AQ02505 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms