Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CNTN2Q02246 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CNTN2Q02246 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNTN2Q02246 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CNTN2Q02246 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CNTN2Q02246 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTN2Q02246 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNTN2Q02246 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNTN2Q02246 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNTN2Q02246 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNTN2Q02246 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNTN2Q02246 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTN2Q02246 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms