Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNFRSF17Q02223 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF17Q02223 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF17Q02223 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms