Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POU5F1Q01860 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POU5F1Q01860 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POU5F1Q01860 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms