Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTBN1Q01082 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms