Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL1Q00532 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL1Q00532 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms