Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK3Q00526 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK3Q00526 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK3Q00526 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms