Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX1P83916 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX1P83916 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CBX1P83916 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CBX1P83916 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX1P83916 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX1P83916 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX1P83916 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX1P83916 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX1P83916 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX1P83916 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX1P83916 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX1P83916 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX1P83916 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX1P83916 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX1P83916 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX1P83916 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX1P83916 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX1P83916 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX1P83916 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX1P83916 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX1P83916 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX1P83916 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX1P83916 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX1P83916 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX1P83916 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX1P83916 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX1P83916 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBX1P83916 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBX1P83916 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBX1P83916 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX1P83916 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX1P83916 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX1P83916 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX1P83916 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX1P83916 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX1P83916 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX1P83916 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX1P83916 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX1P83916 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX1P83916 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX1P83916 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX1P83916 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX1P83916 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX1P83916 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX1P83916 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX1P83916 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX1P83916 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX1P83916 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX1P83916 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX1P83916 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX1P83916 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX1P83916 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX1P83916 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX1P83916 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX1P83916 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBX1P83916 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBX1P83916 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX1P83916 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX1P83916 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX1P83916 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX1P83916 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX1P83916 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX1P83916 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX1P83916 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX1P83916 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX1P83916 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX1P83916 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CBX1P83916 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX1P83916 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX1P83916 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX1P83916 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX1P83916 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX1P83916 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX1P83916 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX1P83916 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX1P83916 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX1P83916 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX1P83916 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX1P83916 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX1P83916 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX1P83916 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX1P83916 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX1P83916 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX1P83916 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX1P83916 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX1P83916 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX1P83916 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX1P83916 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX1P83916 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX1P83916 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX1P83916 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX1P83916 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX1P83916 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX1P83916 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX1P83916 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX1P83916 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX1P83916 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX1P83916 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX1P83916 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms