Protein–RNA interactions for Protein: P78330

PSPH, Phosphoserine phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP78330 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPHP78330 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPHP78330 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPHP78330 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPHP78330 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPHP78330 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPHP78330 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPHP78330 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPHP78330 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPHP78330 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPHP78330 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPHP78330 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPHP78330 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPHP78330 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPHP78330 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPHP78330 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPHP78330 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPHP78330 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPHP78330 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPHP78330 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPHP78330 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPHP78330 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPHP78330 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPHP78330 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPHP78330 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPHP78330 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPHP78330 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPHP78330 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPHP78330 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPHP78330 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPHP78330 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPHP78330 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPHP78330 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPHP78330 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSPHP78330 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSPHP78330 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSPHP78330 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPHP78330 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPHP78330 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPHP78330 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPHP78330 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPHP78330 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPHP78330 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPHP78330 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPHP78330 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPHP78330 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPHP78330 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPHP78330 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPHP78330 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPHP78330 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPHP78330 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPHP78330 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPHP78330 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPHP78330 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPHP78330 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPHP78330 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPHP78330 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPHP78330 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPHP78330 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPHP78330 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPHP78330 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPHP78330 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPHP78330 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPHP78330 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPHP78330 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPHP78330 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPHP78330 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPHP78330 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPHP78330 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPHP78330 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPHP78330 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPHP78330 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPHP78330 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPHP78330 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPHP78330 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPHP78330 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPHP78330 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPHP78330 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPHP78330 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPHP78330 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPHP78330 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPHP78330 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPHP78330 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPHP78330 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPHP78330 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPHP78330 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPHP78330 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPHP78330 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPHP78330 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPHP78330 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPHP78330 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPHP78330 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPHP78330 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPHP78330 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPHP78330 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSPHP78330 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSPHP78330 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSPHP78330 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSPHP78330 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSPHP78330 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.8 ms