Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMC6P62333 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC6P62333 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMC6P62333 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms