Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPFP62306 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPFP62306 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNRPFP62306 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms