Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VBP1P61758 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VBP1P61758 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VBP1P61758 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VBP1P61758 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VBP1P61758 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VBP1P61758 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VBP1P61758 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VBP1P61758 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VBP1P61758 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VBP1P61758 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VBP1P61758 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VBP1P61758 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VBP1P61758 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VBP1P61758 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VBP1P61758 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VBP1P61758 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VBP1P61758 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VBP1P61758 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VBP1P61758 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VBP1P61758 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VBP1P61758 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VBP1P61758 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VBP1P61758 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VBP1P61758 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VBP1P61758 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VBP1P61758 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VBP1P61758 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VBP1P61758 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VBP1P61758 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VBP1P61758 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VBP1P61758 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VBP1P61758 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VBP1P61758 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VBP1P61758 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VBP1P61758 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VBP1P61758 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VBP1P61758 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VBP1P61758 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VBP1P61758 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VBP1P61758 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VBP1P61758 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VBP1P61758 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VBP1P61758 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VBP1P61758 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VBP1P61758 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VBP1P61758 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VBP1P61758 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VBP1P61758 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VBP1P61758 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VBP1P61758 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VBP1P61758 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VBP1P61758 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VBP1P61758 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VBP1P61758 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VBP1P61758 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VBP1P61758 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VBP1P61758 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VBP1P61758 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VBP1P61758 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VBP1P61758 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VBP1P61758 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VBP1P61758 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VBP1P61758 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VBP1P61758 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VBP1P61758 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VBP1P61758 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VBP1P61758 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VBP1P61758 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VBP1P61758 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VBP1P61758 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VBP1P61758 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VBP1P61758 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VBP1P61758 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VBP1P61758 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VBP1P61758 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VBP1P61758 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VBP1P61758 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VBP1P61758 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VBP1P61758 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VBP1P61758 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VBP1P61758 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VBP1P61758 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VBP1P61758 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VBP1P61758 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VBP1P61758 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 297.3 ms