Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVK-21P61565 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVK-21P61565 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVK-21P61565 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms