Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTR3P61158 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTR3P61158 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR3P61158 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms