Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVFRD-1P60508 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ERVFRD-1P60508 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms