Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSX2P58304 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSX2P58304 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSX2P58304 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VSX2P58304 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSX2P58304 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VSX2P58304 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VSX2P58304 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VSX2P58304 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VSX2P58304 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VSX2P58304 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VSX2P58304 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
VSX2P58304 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSX2P58304 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSX2P58304 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSX2P58304 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSX2P58304 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSX2P58304 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSX2P58304 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSX2P58304 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSX2P58304 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSX2P58304 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSX2P58304 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VSX2P58304 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSX2P58304 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSX2P58304 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSX2P58304 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSX2P58304 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSX2P58304 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSX2P58304 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSX2P58304 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSX2P58304 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSX2P58304 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSX2P58304 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSX2P58304 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSX2P58304 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSX2P58304 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSX2P58304 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSX2P58304 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSX2P58304 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSX2P58304 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSX2P58304 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSX2P58304 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSX2P58304 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSX2P58304 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSX2P58304 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSX2P58304 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSX2P58304 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSX2P58304 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSX2P58304 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSX2P58304 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSX2P58304 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSX2P58304 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSX2P58304 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSX2P58304 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSX2P58304 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSX2P58304 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSX2P58304 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSX2P58304 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSX2P58304 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSX2P58304 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VSX2P58304 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSX2P58304 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSX2P58304 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSX2P58304 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VSX2P58304 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSX2P58304 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSX2P58304 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSX2P58304 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSX2P58304 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSX2P58304 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSX2P58304 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSX2P58304 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VSX2P58304 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VSX2P58304 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSX2P58304 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSX2P58304 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VSX2P58304 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSX2P58304 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSX2P58304 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSX2P58304 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSX2P58304 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSX2P58304 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VSX2P58304 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSX2P58304 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSX2P58304 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSX2P58304 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSX2P58304 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSX2P58304 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VSX2P58304 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSX2P58304 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSX2P58304 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSX2P58304 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VSX2P58304 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSX2P58304 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSX2P58304 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSX2P58304 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSX2P58304 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSX2P58304 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSX2P58304 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms