Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX16P57768 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX16P57768 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX16P57768 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX16P57768 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX16P57768 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX16P57768 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX16P57768 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX16P57768 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX16P57768 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX16P57768 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX16P57768 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX16P57768 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX16P57768 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX16P57768 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX16P57768 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX16P57768 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX16P57768 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX16P57768 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX16P57768 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX16P57768 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX16P57768 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX16P57768 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX16P57768 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX16P57768 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX16P57768 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX16P57768 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX16P57768 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX16P57768 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX16P57768 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX16P57768 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX16P57768 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX16P57768 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX16P57768 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX16P57768 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX16P57768 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX16P57768 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX16P57768 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX16P57768 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX16P57768 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX16P57768 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX16P57768 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX16P57768 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX16P57768 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX16P57768 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX16P57768 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX16P57768 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX16P57768 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX16P57768 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX16P57768 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX16P57768 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX16P57768 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX16P57768 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX16P57768 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX16P57768 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX16P57768 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX16P57768 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX16P57768 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX16P57768 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX16P57768 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX16P57768 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX16P57768 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX16P57768 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX16P57768 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX16P57768 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX16P57768 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX16P57768 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX16P57768 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX16P57768 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX16P57768 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX16P57768 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX16P57768 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX16P57768 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX16P57768 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX16P57768 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX16P57768 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX16P57768 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX16P57768 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX16P57768 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX16P57768 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX16P57768 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX16P57768 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX16P57768 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX16P57768 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX16P57768 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX16P57768 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX16P57768 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX16P57768 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX16P57768 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX16P57768 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX16P57768 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX16P57768 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX16P57768 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX16P57768 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX16P57768 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX16P57768 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX16P57768 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX16P57768 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX16P57768 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX16P57768 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms