Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB25P57735 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB25P57735 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB25P57735 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB25P57735 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB25P57735 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB25P57735 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB25P57735 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB25P57735 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB25P57735 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB25P57735 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB25P57735 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB25P57735 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB25P57735 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB25P57735 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB25P57735 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB25P57735 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB25P57735 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB25P57735 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB25P57735 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB25P57735 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB25P57735 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB25P57735 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB25P57735 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
RAB25P57735 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RAB25P57735 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB25P57735 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB25P57735 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB25P57735 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB25P57735 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB25P57735 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB25P57735 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB25P57735 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB25P57735 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB25P57735 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB25P57735 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB25P57735 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB25P57735 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB25P57735 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB25P57735 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB25P57735 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB25P57735 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB25P57735 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB25P57735 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB25P57735 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB25P57735 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB25P57735 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB25P57735 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB25P57735 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB25P57735 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB25P57735 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB25P57735 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB25P57735 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB25P57735 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB25P57735 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB25P57735 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB25P57735 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB25P57735 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB25P57735 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB25P57735 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB25P57735 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB25P57735 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB25P57735 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB25P57735 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB25P57735 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB25P57735 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB25P57735 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB25P57735 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB25P57735 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB25P57735 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB25P57735 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB25P57735 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB25P57735 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB25P57735 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB25P57735 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB25P57735 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB25P57735 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB25P57735 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB25P57735 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB25P57735 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB25P57735 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB25P57735 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB25P57735 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB25P57735 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB25P57735 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB25P57735 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB25P57735 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB25P57735 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB25P57735 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB25P57735 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB25P57735 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB25P57735 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB25P57735 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB25P57735 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB25P57735 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB25P57735 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB25P57735 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB25P57735 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB25P57735 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB25P57735 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms