Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN17P56750 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN17P56750 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN17P56750 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN17P56750 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN17P56750 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN17P56750 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN17P56750 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN17P56750 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN17P56750 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN17P56750 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN17P56750 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN17P56750 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN17P56750 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN17P56750 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN17P56750 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN17P56750 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN17P56750 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLDN17P56750 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN17P56750 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN17P56750 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN17P56750 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN17P56750 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLDN17P56750 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN17P56750 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN17P56750 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN17P56750 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN17P56750 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN17P56750 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLDN17P56750 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN17P56750 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN17P56750 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms