Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTBP2P56545 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTBP2P56545 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms