Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
OXCT1P55809 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OXCT1P55809 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OXCT1P55809 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms