Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNU13P55769 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNU13P55769 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNU13P55769 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNU13P55769 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNU13P55769 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNU13P55769 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNU13P55769 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNU13P55769 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNU13P55769 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNU13P55769 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNU13P55769 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNU13P55769 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNU13P55769 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNU13P55769 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNU13P55769 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNU13P55769 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNU13P55769 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNU13P55769 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNU13P55769 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNU13P55769 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNU13P55769 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNU13P55769 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNU13P55769 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNU13P55769 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNU13P55769 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNU13P55769 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNU13P55769 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNU13P55769 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNU13P55769 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNU13P55769 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNU13P55769 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNU13P55769 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNU13P55769 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNU13P55769 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNU13P55769 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNU13P55769 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNU13P55769 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNU13P55769 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNU13P55769 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNU13P55769 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNU13P55769 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNU13P55769 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNU13P55769 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNU13P55769 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNU13P55769 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNU13P55769 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNU13P55769 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNU13P55769 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNU13P55769 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNU13P55769 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNU13P55769 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNU13P55769 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNU13P55769 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNU13P55769 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNU13P55769 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNU13P55769 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNU13P55769 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SNU13P55769 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNU13P55769 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNU13P55769 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNU13P55769 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNU13P55769 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNU13P55769 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNU13P55769 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNU13P55769 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNU13P55769 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNU13P55769 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNU13P55769 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNU13P55769 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNU13P55769 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNU13P55769 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNU13P55769 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNU13P55769 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNU13P55769 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNU13P55769 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNU13P55769 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNU13P55769 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNU13P55769 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNU13P55769 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNU13P55769 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNU13P55769 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNU13P55769 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNU13P55769 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNU13P55769 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNU13P55769 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms