Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC13P55735 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC13P55735 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC13P55735 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC13P55735 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC13P55735 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC13P55735 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC13P55735 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC13P55735 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC13P55735 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC13P55735 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC13P55735 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC13P55735 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC13P55735 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC13P55735 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC13P55735 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC13P55735 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC13P55735 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC13P55735 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC13P55735 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC13P55735 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC13P55735 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC13P55735 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC13P55735 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC13P55735 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC13P55735 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC13P55735 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC13P55735 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC13P55735 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC13P55735 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC13P55735 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC13P55735 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC13P55735 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC13P55735 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC13P55735 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC13P55735 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC13P55735 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC13P55735 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC13P55735 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC13P55735 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC13P55735 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC13P55735 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC13P55735 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC13P55735 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC13P55735 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC13P55735 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC13P55735 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC13P55735 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC13P55735 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC13P55735 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC13P55735 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC13P55735 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC13P55735 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC13P55735 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC13P55735 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC13P55735 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC13P55735 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC13P55735 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC13P55735 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC13P55735 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC13P55735 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC13P55735 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC13P55735 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC13P55735 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC13P55735 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC13P55735 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC13P55735 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC13P55735 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC13P55735 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC13P55735 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC13P55735 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC13P55735 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC13P55735 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC13P55735 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC13P55735 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC13P55735 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC13P55735 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC13P55735 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC13P55735 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC13P55735 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC13P55735 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC13P55735 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC13P55735 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC13P55735 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC13P55735 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC13P55735 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC13P55735 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC13P55735 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC13P55735 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC13P55735 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC13P55735 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC13P55735 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC13P55735 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC13P55735 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC13P55735 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC13P55735 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC13P55735 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC13P55735 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC13P55735 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC13P55735 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms