Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH12P55289 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH12P55289 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH12P55289 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH12P55289 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH12P55289 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH12P55289 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH12P55289 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH12P55289 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH12P55289 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH12P55289 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH12P55289 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH12P55289 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH12P55289 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH12P55289 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH12P55289 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH12P55289 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH12P55289 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH12P55289 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH12P55289 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH12P55289 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH12P55289 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH12P55289 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH12P55289 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH12P55289 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH12P55289 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH12P55289 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH12P55289 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH12P55289 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH12P55289 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH12P55289 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH12P55289 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH12P55289 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH12P55289 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH12P55289 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH12P55289 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH12P55289 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH12P55289 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH12P55289 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH12P55289 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH12P55289 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH12P55289 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH12P55289 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH12P55289 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH12P55289 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH12P55289 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH12P55289 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH12P55289 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH12P55289 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH12P55289 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH12P55289 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH12P55289 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH12P55289 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH12P55289 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH12P55289 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH12P55289 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH12P55289 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH12P55289 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH12P55289 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH12P55289 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH12P55289 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH12P55289 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH12P55289 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH12P55289 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH12P55289 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH12P55289 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH12P55289 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH12P55289 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH12P55289 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH12P55289 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH12P55289 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH12P55289 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH12P55289 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH12P55289 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH12P55289 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH12P55289 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH12P55289 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH12P55289 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH12P55289 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH12P55289 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH12P55289 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH12P55289 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH12P55289 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH12P55289 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH12P55289 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH12P55289 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH12P55289 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH12P55289 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH12P55289 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH12P55289 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH12P55289 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH12P55289 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH12P55289 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH12P55289 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH12P55289 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH12P55289 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH12P55289 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH12P55289 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH12P55289 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH12P55289 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms