Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HADHBP55084 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HADHBP55084 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HADHBP55084 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HADHBP55084 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HADHBP55084 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HADHBP55084 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HADHBP55084 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HADHBP55084 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HADHBP55084 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HADHBP55084 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HADHBP55084 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HADHBP55084 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HADHBP55084 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HADHBP55084 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HADHBP55084 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HADHBP55084 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HADHBP55084 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HADHBP55084 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HADHBP55084 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HADHBP55084 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HADHBP55084 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HADHBP55084 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HADHBP55084 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HADHBP55084 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HADHBP55084 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HADHBP55084 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HADHBP55084 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HADHBP55084 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HADHBP55084 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HADHBP55084 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HADHBP55084 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HADHBP55084 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HADHBP55084 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HADHBP55084 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HADHBP55084 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HADHBP55084 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HADHBP55084 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HADHBP55084 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HADHBP55084 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HADHBP55084 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HADHBP55084 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HADHBP55084 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HADHBP55084 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HADHBP55084 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HADHBP55084 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHBP55084 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHBP55084 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHBP55084 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHBP55084 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHBP55084 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHBP55084 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHBP55084 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHBP55084 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHBP55084 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HADHBP55084 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HADHBP55084 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HADHBP55084 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HADHBP55084 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
HADHBP55084 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HADHBP55084 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HADHBP55084 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HADHBP55084 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HADHBP55084 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HADHBP55084 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HADHBP55084 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HADHBP55084 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HADHBP55084 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HADHBP55084 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HADHBP55084 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HADHBP55084 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HADHBP55084 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HADHBP55084 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHBP55084 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHBP55084 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHBP55084 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHBP55084 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHBP55084 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHBP55084 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHBP55084 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HADHBP55084 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHBP55084 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHBP55084 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHBP55084 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHBP55084 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHBP55084 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HADHBP55084 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HADHBP55084 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HADHBP55084 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HADHBP55084 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HADHBP55084 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HADHBP55084 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HADHBP55084 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HADHBP55084 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HADHBP55084 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HADHBP55084 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HADHBP55084 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HADHBP55084 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HADHBP55084 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HADHBP55084 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms