Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATP1B3P54709 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATP1B3P54709 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1B3P54709 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms